5. Управління бюджетних надходжень та операцій з фінансовим ресурсом
-відділ бюджетних надходжень
- відділ операцій з фінансовим ресурсом
6. Управління видатків бюджетів та міжбюджетних відносин
- відділ видатків державного бюджету
- відділ видатків місцевих бюджетів та міжбюджетних відносин
7. Управління обслуговування розпорядників коштів та інших клієнтів
- відділ обслуговування розпорядників коштів та інших клієнтів державного бюджету
- відділ обслуговування розпорядників коштів та інших клієнтів місцевих бюджетів
8. Управління консолідованої звітності
- відділ звітності про виконання державного бюджету
- відділ звітності про виконання місцевих бюджетів
9. Управління бухгалтерського обліку операцій з виконання бюджетів
- відділ бухгалтерського обліку
- відділ оперативного контролю за виконанням операцій з бюджетів
10. Управління інформаційних технологій
- відділ обслуговування комп’ютерної техніки
- відділ підтримки користувачів та електронних сервісів
12. Відділ адміністративно-господарської роботи
14. Сектор з питань захисту інформації
15. Головний спеціаліст із закупівель
16. Головний спеціаліст режимно-секретної роботи
17. Головний спеціаліст з питань запобігання та виявлення корупції